Το γυναικείο τμήμα της Ν. Ιωνίας αποτελεί ένα από τα πιο πετυχημένα σωματεία στην ιστορία του πρωταθλήματος και του Κυπέλλου Γυναικών και ένας από τους συλλόγους με τις περισσότερες συμμετοχές σε final four και τελικούς του Κυπέλλου Γυναικών.
Το 2011 κατέκτησε το 1ο κύπελλο, όταν αγωνίστηκε με την Αναγέννηση Άρτας, το 2ο το 2013 αγωνιζόμενη πάλι με την ομάδα της Άρτας, το 3ο το 2015 κόντρα στον ΠΑΟΚ και τη διετία 2017-18 κατάφερε να πάρει τον τίτλο από τις ίδιες ομάδες.
Επίσης η ομάδα της Νέας Ιωνίας έχει φτάσει 7 φορές σε τελικούς Κυπέλλου. Στους ημιτελικούς δε της διοργάνωσης έχει συμμετάσχει 13 φορές, αλλά το αξιοσημείωτο είναι πως μόνο σε 2 διοργανώσεις δεν τα φτάσει έως την 4άδα (το 2001 και το 2007).
Τη φετινή αγωνιστική σεζόν, η ομάδα του Μενέλαου Δανήλου αποτελείται από ένα νεανικό ρόστερ με στόχο στο μέλλον να ξαναπάρει τα σκήπτρα για την επιστροφή στην κορυφή (και σε πρωτάθλημα και σε Κύπελλο).
Όσον αφορά το Κύπελλο για το 2020, η Ν. Ιωνία προκρίθηκε άνετα στα προημιτελικά κόντρα στις κορασίδες του Καματερού και έρχεται στα ημιτελικά να αντιμετωπίσει την Βέροια 2017.
Δείτε την πορεία της Βέροιας 2017 εδώ.
Μετά την κλήρωση για τους ημιτελικούς, απέφυγε τις δύο ομάδες που παραδοσιακά κοντράρεται σε πρωτάθλημα αλλά και σε Κύπελλο, τον ΠΑΟΚ και την Αναγέννηση Άρτας.
Η ομάδα της Ιωνίας δείχνει μέρα με τη μέρα και πιο ανταγωνιστική και αυτό αποδείχτηκε στο τελευταίο παιχνίδι που έδωσε με τον ΠΑΟΚ, στο οποίο έχασε στις λεπτομέρειες ενώ είχε τον έλεγχο σε όλο το ματς.